• TXSearchとは
• 使用方法について
• Versionと更新日について

TXSearchとは

TXSearchは、DDBJのスタッフにより開発された、DDBJ、GenBankおよびEMBLにより統合化された生物分類データベース（Taxonomy Database）を検索するシステムです。DDBJに塩基配列を登録する際に、生物分類名を確認するために利用できます。

塩基配列データベース構築には由来生物名の管理は必須であり、生物名の表記を統一する必要があります。この生物名の参照先としてこのTaxonomy database を使用しております。
Taxonomy database は、生物名の表記を統一することに主眼をおいて構築されており、生物種の命名、および、分類学上の権威となるものではありません。
Taxonomy database の説明につきましてはこちらをお読みください。
したがって、Taxonomy database で採用されている生物分類名は、登録者の分類学的な主張、および、分類学的に普及している内容とは異なる場合があります。

使用方法について

分類単位名と、分類名のクラス、分類階級を指定して、検索することができます。 検索結果は、２段階で表示されます。最初に、検索条件に適合するすべての分類単位の一覧が表示されます（検索結果一覧頁）。さらに詳しい情報を知りたい場合は、該当する分類単位名をクリックしてください（検索結果詳細頁）。DDBJ塩基配列データベースから、その分類単位名に関連したエントリーを検索することができます（関連エントリー検索結果頁）。

1. 分類単位（taxon）名［Homo sapiens, Primates, Mammaliaなど］
   • 128文字まで入力することができます。

   • 検索方法を選択してください。指定した語と完全に一致する分類単位名を検索対象とする場合は「完全一致」を選択してください。また、指定した語を含む全ての分類単位名を検索対象とする場合は「部分一致」を選択してください。
     ID番号で検索する場合には「taxonomy id」を選択してください。

   • *は、ワイルドカード（任意の文字列）として取り扱われます。
     例えば、*coliを指定すると、大腸菌他、coliで終わる分類単位名がすべて検索されます。また，*bear*を指定すると，bearという語を含む全ての分類単位名が表示されます。

   • 大文字、小文字の区別はありません。例えば、*coliと*CoLIを指定して検索しても、結果はまったく同じです。

   • 種小名のみで生物種を指定する場合には、種小名の前に*を挿入して、「完全一致」を選択してください。（例：大腸菌の場合には、*coli）
     

2. 分類名のクラス［学名・一般名・別名などの区別］

   指定した分類単位名が、学名である場合、「scientific name」を選択してください。
   俗名である場合、「common name」を選択してください。分類名のクラスを特定しない場合、「All」を選択してください。

3. 分類階級［Order, Family, Speciesなどの区別］

   指定した分類単位名の階級（ランク）を選択してください。分類階級を特定しない場合、「All」を選択してください。

Versionと更新日について

Versionはシステムバージョン、更新日はシステムまたは表示（お知らせの掲載を含む）を更新した日付けです。

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